Согласно Указа Президента Республики Беларусь №40 от 27.01.2003 "О совершенствовании управления организациями агропромышленного комплекса" и приказа МСХП РБ №42 от 17.02.2003 Государственное учреждение «Могилёвская областная государственная инспекция по семеноводству, карантину и защите растений» (далее - учреждение) образовано при реорганизации путем слияния Сельскохозяйственного учреждения «Могилёвская областная государственная семенная инспекция», Могилёвской областной государственной инспекции по карантину растений и Государственного учреждения «Могилёвская областная станция защиты растений».
Учредителем учреждения является Министерство сельского хозяйства и продовольствия Республики Беларусь.
Учреждение является территориальной организацией государственного учреждения «Главная государственная инспекция по семеноводству, карантину и защите растений».
Учреждение финансируется из республиканского бюджета и является бюджетной организацией.